Patogeny: na mrkvi – Phoma rostrupii, na petržele, fenyklu a kmínu – Phoma anethi, oddělení Deuteromycota. V prvním roce pěstování mrkve se na řapících a žilkách listů mladých rostlin objevují šedohnědé skvrny a postižená pletiva se stávají křehkými. Horní část okopanin hnije. Na povrchu okopanin se tvoří šedé, mírně promáčklé skvrny a malé černé tečky (pyknidie); tkanina vespod je suchá, shnilá, hnědé barvy; při těžkém poškození se v tkáni tvoří dutiny vystlané bílým myceliem. Když se dospělé rostliny a semena nakazí, objeví se na stoncích a na vidlicích tmavé pruhy a skvrny s fialovým odstínem. Postižená místa postupně vysychají, zesvětlují a pokrývají se pyknidy. Na řapících a žilkách listů mrkve postižených touto chorobou se objevují světle šedohnědé skvrny s pyknidami. Pyknidie se tvoří i na semenech. Zdroje infekce: rostlinné zbytky a semena, na kterých jsou zachovány houbové pyknidy; šíří se konidie (pyknospory).
Prášková plíseň.
Původcem je houba Erysiphe umbelliferarum, divize Ascomycota. Postihuje rostliny čeledi celerovitých v prvním a druhém roce pěstování. Objevuje se na listech, řapících, stoncích a květenstvích ve formě bílého práškového povlaku. Později se ve hmotě mycelia tvoří kleistothecia. Zdroje infekce: kleistothecia na rostlinných zbytcích; šíří konidiemi.
Alternaria.
Původcem je Alternaria radicina, divize Deuteromycota. Nejprve zčernání kořenového krčku, následně žloutnutí, vadnutí a zasychání listů celé růžice. Při této chorobě mrkve se za vlhkého počasí na postižené tkáni objevuje olivově hnědý povlak. Během skladování se na povrchu okopanin na stranách nebo vršcích objevují suchá prohlubněná místa. Pod skvrnou je tkáň uhlově černá, jasně ohraničená od zdravé tkáně. U rostlin druhého roku, jejichž kořeny jsou napadeny Alternaria, se stonky a květenství nevyvíjejí vůbec nebo před květem usychají a usychají. Zdroje infekce: mycelium, konidie v semenech, zbytky rostlin, nemocné okopaniny; šíří konidiemi. 
Bílá hniloba nebo sklerotinie.
Původcem je Sclerotinia sclerotiorum, divize Deuteromycota. Objevuje se na všech plodinách z čeledi celerovitých. Tkanina změkne bez změny barvy; jeho povrch je pokryt bílým povlakem podobným bavlně. Postupem času se na myceliu vytvoří velká sklerocia. Zdroje infekce: sklerocia v půdě, semena.
Šedá hniloba.
Původcem je Botrytis cinerea, divize Deuteromycota. Postižená tkáň změkne, zhnědne a na povrchu se vytvoří nadýchaný šedý povlak, tvořený myceliem houby a její sporulací. Později se tvoří malá sklerocia. Během skladování se šedá hniloba snadno rozšíří na další okopaniny při kontaktu a pomocí konidií. Zdroje infekce: sklerocia a konidie jsou zachovány na rostlinných zbytcích, v odumřelých částech zimujících okopanin, v půdě; šíří konidiemi. 
Rhizoktonióza, nebo suchá fialová hniloba, plstěná nemoc.
Původcem je Rhizoctonia violacea, divize Deuteromycota. Postihuje mnoho plodin: mrkev, petržel atd. Při této chorobě žloutnou a zasychají vršky mrkve, na kořenech se tvoří olověně šedé propadlé skvrny, které jsou pak pokryty plstnatým povlakem hnědofialové barvy. Později se vytvoří malá černá pseudosklerocia. Zdroje infekce: sklerocia zůstávající v půdě a na napadených rostlinných zbytcích.
Prášková plíseň
Původcem je Plasmopara nivea, divize Oomikota. Na horní straně se objevují nejasné žluté nebo hnědé skvrny, které se zvětšují a často splývají. Při vysoké vlhkosti se na spodní straně listů, v místech, kde se nacházejí skvrny, tvoří bílý povlak. Kromě nepohlavní sporulace tvoří patogen v pletivech napadené rostliny oospory. Zdroje infekce: oospory v rostlinných zbytcích, v půdě, v semenech. Šíří se zoosporami.
Cercosporóza
Původcem je Cercospora depressa, divize Deuteromycota. Během pěstování se na kořenových plodinách mrkve postižených touto chorobou tvoří světlé skvrny s červenohnědým okrajem a šedobílý povlak. Na listech jsou kulaté skvrny; při těžkém poškození splývají a destičky vysychají. Na řapících listů a stonků mají skvrny protáhlý tvar. Zdroje infekce: konidie v rostlinných zbytcích; šíří se konidiemi deštěm a větrem.
Bakterióza
Původcem je bakterie Xanthomonas campestrispv. carotae. Na spodních listech se tvoří malé žluté, postupně tmavnoucí skvrny. Nemocné listy žloutnou a zasychají. Skvrny na stoncích jsou tmavě hnědé a vodnaté. Při postižení uzlin tkáň ztmavne, objeví se exsudát a postupně taková místa vysychají. Na kořenové zelenině jsou skvrny malé, hnědé, propadlé, protáhlé; při pozdní infekci vznikají léze podobné strupům. Zdroje infekce: nemocné kořeny, semena a zbytky rostlin.
Mrkvová skvrna
Trioza apiculis (řád Homoptera, čeleď Psyllium) – škodlivá, hlavně v severozápadní oblasti. Poškozuje mrkev, petržel, kopr, celer, pastinák a další rostliny z čeledi celerovitých. Malý, až 2 mm dlouhý, nazelenalý hmyz s pronikavě sajícími ústy, červenýma očima, vláknitými tykadly, zadními skákacími nohami a průhlednými křídly. Larva tohoto škůdce mrkve je malá, téměř nehybná, zelenožlutá a plochá. Kolem jejího těla jsou voskové nitě v podobě třásní. Dospělci přezimují v korunách borovic, méně často než ostatní jehličnany podél okrajů lesa. Při nedostatku jehličnanů mohou zimovat na celeru. Na jaře nalétávají na výhonky mrkve a kladou vajíčka na okraje mladých listů, přičemž každá samice je schopna naklást až 500–700 vajíček. Vylíhlé larvy jsou nasávány na bázi listů. Jejich vývoj pokračuje asi měsíc. V srpnu až září se samice vracejí do jehličnatých rostlin, aby kladly vajíčka. Během roku se vyvine 1 generace. Krmení jitrocele způsobí „kudrnatí“ listů, které však neztrácejí barvu. Kořenová zelenina ale roste pomaleji a hořkne. Silně poškozené rostliny někdy odumírají. Děje se tak proto, že hmyz při krmení vnáší do rostliny své sliny, které jsou pro mrkev a další poškozené plodiny velmi toxické a způsobují nežádoucí biochemické změny.
deštníkový můra
Depressaria depressana (řád Lepidoptera, čeleď můry širokokřídlí) je běžná v evropské části Ruska; nejškodlivější v oblasti centrální černozemě, Volhy a severního Kavkazu. Poškozuje generativní orgány mrkve, kopru, petržele, celeru a dalších rostlin z čeledi celerovitých. Podívejte se na fotografii – tento škůdce mrkve je motýl s rozpětím křídel 13-19 mm; přední křídla jsou hnědá, s malou příměsí bělavých šupin; zadní – šedé; hlava a pronotum světle žlutá nebo načervenalá: Housenka až 10-13 mm dlouhá, hnědá s načervenalým nádechem. Motýli přezimují pod volnou kůrou stromů, uvnitř tlustých dutých stonků některých divokých rostlin, někdy pod rostlinnými zbytky a na jiných suchých, odlehlých místech. Motýli, kteří vylétají na jaře, obvykle ve fázi pučení porostů celeru, kladou vajíčka na květenství po jednom nebo ve skupině 3-11 kusů. Průměrná plodnost samic je asi 300 vajíček. Po 4-8 dnech se vylíhnou housenky, které se 2-3 týdny živí, požírají různé části květenství, ničí poupata, květy, tvoří semena a ohlodávají pedicely. Květenství mrkve na zahradě poškozené tímto hmyzím škůdcem jsou staženy pavučinami. Po dokončení vývoje se housenky zakuklí v pavučinových zámotcích na krmných místech. Kukla se vyvíjí za 7-10 dní. Vznikající motýli začnou brzy hledat úkryt, kde vstoupí do zimní diapauzy. Škůdce produkuje 1 generaci za rok všude. K boji proti tomuto škůdci mrkve se v případě potřeby doporučuje používat doporučené insekticidy.
Mrkněte mrkev
Psila rosae (řád Diptera, čeleď Psilidae) – rozšířená v evropské části Ruska. Poškozuje mrkev, pastinák, petržel, celer a další rostliny z čeledi Umbelliferae s výraznými kořeny. Dospělec je asi 5 mm dlouhý s protáhlým, leskle černým tělem; hlava je žlutočervená. Larva je až 7 mm dlouhá, červovitá, beznohá, špinavě žluté barvy. Kukly přezimují v půdě a larvy přezimují uvnitř okopanin ve skladech zeleniny. Výskyt much na jaře se obvykle shoduje s kvetením jeřábů a jabloní. Samičky kladou vajíčka v malých skupinách na půdu na bázi mladých rostlin, preferují zastíněné a husté plodiny mrkve. Jejich průměrná plodnost je něco málo přes 100 vajíček. Larvy, které se vylíhnou po 1-2 týdnech, pronikají do kořenové plodiny a mají v ní úzké klikaté průchody, což často způsobuje její hnilobu. Po 20-25 dnech se larvy, které dokončily svůj vývoj, zakuklí v půdě. Ve většině regionů Ruska se vyvíjejí 2 generace škůdce.
